Biognosys meldet Publikation in Nature Communications in Zusammenarbeit mit der ETH Zürich, Bayer und BASF

In dieser Publikation stellen wir einen neuartigen chemoproteomischen Arbeitsablauf vor, der die LiP und auf maschinellem Lernen basierende Datenanalyse kombiniert. Dieser Proteomik-Ansatz der nächsten Generation ermöglicht die Identifizierung kleinmolekularer Wirkstoffziele in komplexen Proteomen und die Analyse ihrer Bindungseigenschaften bei verschiedenen Spezies und Wirkstoff-Target-Klassen.

Oliver Rinner, Chief Executive Officer von Biognosys, kommentierte: „Den Wirkmechanismus eines Wirkstoffs zu verstehen ist nach wie vor eine große Herausforderung in der Arzneimittelentwicklung. Mit dieser Publikation zeigen wir, dass wir uns der Unterstützung unserer Pharma- und Biotech-Partner mit einzigartigen Anwendungen für eine effizientere Arzneimittelentwicklung verschrieben haben.“

Lukas Reiter, Chief Technology Officer, führte aus: „Die quantitative Proteomik-Technologie von Biognosys, die auf der datenunabhängigen Akquisition (DIA) basiert, passt perfekt zur LiP-Technologie. Mit diesem kombinierten Arbeitsablauf konnten wir einen Ansatz zur Dekonvolution von Zielproteinen für menschliche Zelllinien entwickeln.“

Prof. Dr. Paola Picotti, Assistenzprofessorin für die Biologie von Proteinnetzwerken und Gruppenleiterin an der ETH Zürich sowie wissenschaftliche Beraterin von Biognosys, sagte: „Mit dem LiP-Ansatz können wir nun auch die Wirkstoffbindung in sehr komplexen Säugetierzell-Systemen mit hoher Sicherheit identifizieren. Zudem erhalten wir Informationen über die Bindungsaffinität, sodass wir Zielproteine für Folgestudien besser priorisieren können.“

Thomas Knobloch, Laborleiter bei Bayer CropScience, ergänzte: „Die LiP-Technologie ist ein sehr wertvolles Instrument zur Target- und Off-Target-Identifizierung von neuartigen Wirkstoffen unabhängig vom Organismus und zur Unterstützung des Prozesses der Target-Dekonvolution in der Frühphasenforschung.“

Biognosys hat in diesem Jahr auf der Konferenz der US Human Proteome Organization (HUPO) und der Jahrestagung der American Association for Cancer Research (AACR) bereits Forschungsergebnisse veröffentlicht, die den Nutzen der LiP-basierten Proteomik für die Arzneimittelentwicklung belegen.

Über die Limitierte Proteolyse (LiP)

Der neuartige Ansatz der Limitierten Proteolyse in Kombination mit der quantitativen Massenspektrometrie der nächsten Generation ermöglicht die unvoreingenommene und proteomweite Profilierung von Proteinveränderungen, die durch eine Vielzahl von Stimuli wie beispielsweise Hitzeschock, Protein-Protein-Interaktionen, Wirkstoffbindung und posttranslationale Modifikationen entstehen.

Diese patentierte Technologie wurde in der Gruppe von Prof. Paola Picotti an der ETH Zürich erfunden. Biognosys hat diese patentierte Technologie mitentwickelt und verfügt über eine exklusive Lizenz dafür, um Partner aus dem Pharma- und Biotechbereich mit Vertragsforschungsdienstleistungen für die Erforschung und Entwicklung von Wirkstoffen zu unterstützen. Biognosys bietet bereits eine auf der LiP-Technologie basierende Anwendung zur Dekonvolution von Zielproteinen an und entwickelt weitere, auf maschinellem Lernen basierende Anwendungen zur Validierung von Zielproteinen.

Weitere Informationen finden Sie hier.

Quellenangaben

Piazza I et al. A machine learning-based chemoproteomic approach to identify drug targets and binding sites in complex proteomes. Nature Communications (2020)11:4200.

DOI: 10.1038/s41467-020-18071-x

Die Ausgangssprache, in der der Originaltext veröffentlicht wird, ist die offizielle und autorisierte Version. Übersetzungen werden zur besseren Verständigung mitgeliefert. Nur die Sprachversion, die im Original veröffentlicht wurde, ist rechtsgültig. Gleichen Sie deshalb Übersetzungen mit der originalen Sprachversion der Veröffentlichung ab.

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